При розробці програми FileZilla було поставлено наголос на підтримку якнайбільшої функціональності програми, при збереженні швидкої і надійної роботи. Результат - програма, що володіє приємним і зручним інтерфейсом, має велику кількість настройок, опцій і можливостей. Працювати з нею буде легко, як простим користувачам так і професіоналам.

FileZilla легко настроюється під конкретну роботу. Є підтримка функції Drag and Drop, забезпечується докачка файлів (якщо сервер це підтримує).
Основні особливості програми FileZilla:

- Підтримує FTP, FTP під SSL/TLS (FTPS) і SSH File Transfer Protocol (SFTP).
- Робота в декілька потіків.
- Захист з'єднання (SSL).
- Відновлення з'єднання (Keep Alive).
- Визначення таймауту FTP-сервера.
- Багатомовний інтерфейс FileZilla (зокрема російський).
- Підтримка докачки файлів розмірами більше 4GB.
- Потужний менеджер сайтів і черги передачі файлів.
- Настройка лімітів швидкості.
- Фільтр імен файлів.
- Помічник настройки конфігурації мережі.
- Аутентифікація і шифровка за допомогою Kerberos.

Розробники відзначають те що FileZilla без проблем працює з багатьма популярними файерволами (якщо їх правильно налаштувати). Це забезпечує захист даних при роботі з віддаленим FTP-сервером.
Зміни в останній версії:

Виправлено тип входу в обліковий запис в поєднанні з FTP проксі.